RNF213-/- hCMEC/D3细胞培养上清来源外泌体circRNAs表达谱的特征
来源期刊:
广州医药
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发布时间:
收稿时间:2026/6/5 9:13:28
阅读量:4
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- 关键词:
- 烟雾病;RNF213;外泌体;circRNA;hCMEC/D3细胞;生物信息学
- moyamoya disease; RNF213; exosome; circRNA; hCMEC/D3 cells; bioinformatics
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目的: 探讨RNF213基因敲除对hCMEC/D3细胞分泌的外泌体circRNAs表达谱的影响。方法: 采用尺寸排阻法分别从RNF213-/- hCMEC/D3细胞(KO组)和野生型细胞(WT组)培养上清中提取外泌体,用Illumina Novaseq 6000 平台检测外泌体circRNAs表达谱,并用生物信息学方法进行分析。结果: 两组细胞存在134种差异表达的外泌体circRNAs,其中116种上调,18种下调。GO分析结果中,cellular nitrogen compound metabolic process (BP), intracellular anatomical structure (CC), heterocyclic compound binding (MF)和organic cyclic compound binding (MF)是最丰富的术语。Polycomb repressive complex通路是KEGG分析最显著富集的通路。circHIPK3可能通过ceRNA机制和/或与RNA结合蛋白相互作用参与烟雾病的发生发展,并成功构建circRNA-miRNA-mRNA通路。结论: 本研究确定了RNF213-/- hCMEC/D3细胞与野生型细胞外泌体circRNAs的差异表达谱,从外泌体的视角,为烟雾病的发病分子机制提供了新的见解。
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